聖紀文是主後一百五十年一位希臘基督教聖者的名字，他認為「無知」和「謬誤」是世界上最大的罪惡；「無知」使人愚昧，有了知識懂得思考，作事不再「謬誤」。也是當年有意創辦一所天台小學的陸紀先生和鍾國文先生的名字，李求恩會吏長將學校命名為聖公會聖紀文小學的原因。

        香港在第二次世界大戰後，是一個資源非常缺乏的城市，李會吏長眼見一群群失學的兒童，在徙置區終日流離浪蕩，沒有機會接受教育，甚為可惜，因此向政府建議，利用當時徙置區的天台，作為校舍開辦學校，使這些失學的兒童，得有機會接受教育，是一個好的提議。此建議得到政府的認同，批准辦學，是全港首間天台學校。其後，陸先生和鍾先生因為資源問題，將學校交與教會承辦。李會吏長為失學兒童光學的理念，得到何明華主教的認同，由教會擔任辦學團體的角色，向政府提出要求撥地興建校舍。校舍落成，學校從天台校舍搬到如今的校址。首任校監李守正牧師，就是李會吏長的公子；並由劉雪峰先生擔任首任總校長。

        學校落成後，周圍的環境，並不是設立學校的理想地點，幸賴劉總校長頻密的家訪，向附近的居民推介，經過了幾年艱苦的歲月，聖紀文才能成為這區一所有名的學校，學生數目日漸上升。繼李牧師後，聖紀文的校監先後有黎韋潔蓮女士、李乃元先生、周岐伯先生，總校長有劉筱基女士、林浩基先生，曾仲然先生、張國光先生，這些都是聖公會有名望的教育工作者，在他們的努力耕耘下，得到各方面的認同，本校在2000年獲選為本區兩所最受歡迎學校之一。

        本校自一九六九年創辦以來，迄今已踏入五十五年了。本校本著古聖賢的精神辦學，在歷任校監，校董、校長策劃和領導，以及老師的努力和家長的支持下，在長沙灣區作育英才、深受愛戴，學生均以「非以役人，乃役於人」為己任。本校現由蘇啟明先生擔任校監，並由馬俊江先生擔任校長，實行優質教學，全校上下同心衷誠合作，對推動資訊科技、聯課活動活動、良好的紀律及提高學科成績不遺餘力，各項成績亦已立竿見影。